美国留学还是日本？
建议美本申请master，美硕申请phd； 原因如下： 美国本科和硕士的教育体制更有利于你今后进入研究型高校（无论是美国还是其他国家）。因为美国的硕士一般只有1年，而且大部分是学分制，如果选课选的好，可能不到一年就能拿到硕士学位，这样的学业进度会为日后申请phd提供良好的基础。而日本的硕士都是2年制的，虽然相对较便宜，但是毕业后选择phd的话需要重新评估你现在的研究兴趣及方向是否有变化，要不要重新来读。
美国本硕的学习经历会比你在日本从学士到硕士的经历在美国研究生的申请中更有优势。毕竟美国大学更相信本土教育体制下培养出来的人才，尤其是你选择申请理工科专业。当然，除了博士阶段，美国大学的理工科硕士也是很难申请的。如果你打算去日本读专门职学位，那在毕业以后想再办工作签证过来美国找工作是非常困难的(因为美国移民局不会认同你的专业是计算机或者工程师类)，除非你能确保自己可以找到愿意发非移民签证给你去美国工作的公司。
另外说一点个人意见，如果你有考虑过将来办投资移民或者绿卡之类的话，那么推荐你去美国读本科和硕士。因为如果你在日本读了硕士或博士后再去申报投资移民的话，你所在的公司需要在美设立分公司，并且你作为高级管理人员需要在美的公司有实际的工作内容，这样会比较麻烦且成功率也不能保证。但如果是美国本科毕业并且有硕士学位的话，这种情况申办投资移民的成功率就会高很多。
希望对你有帮助。